Si tratta di un'agenzia speciale militare  sottoposta al controllo delle Nazioni Unite. I suoi scopi ufficiali risiedono nello studio e l'annientamento degli esseri denominati Angeli, medesimi fini per i quali è stato varato il Progetto E, volto  allo sviluppo degli Evangelion. Sebbene controllata e finanziata dalla Commissione per il Perfezionamento dell'Uomo, una commissione esecutiva delle Nazioni Unite, la Nerv gode tuttavia di una pressoché totale autonomia di azione nell'ambito delle questioni di sua competenza. Il termine 'speciale' sta infatti ad indicare come questa agenzia sia stata istituita e sia regolata da leggi speciali che la pongono in una posizione privilegiata nei confronti delle altre autorità, sia militari che civili. La sede centrale della Nerv è situata in Giappone ed ha il suo Quartier Generale all'interno del Geo Front, sotto la città di Neo Tokyo-3, ma l'Agenzia conta numerose divisioni dislocate in tutto il Mondo (Germania e Stati Uniti fra le altre).  La sua organizzazione interna comprende vari reparti, che spaziano dalla ricerca tecnologica alla gestione delle pubbliche relazioni (ovvero all'insabbiamento davanti all'opinione pubblica di fatti spiacevoli o top secret). Il comandante supremo della Nerv è Gendo Ikari, coadiuvato e all'occorrenza sostituito dal vicecomandante Kozo Fuyutsuki.